Ο Κώστας Γιαννακόπουλος σπούδασε νομικά και φιλολογία στο Πανεπιστήμιο Αθηνών. Έκανε μεταπτυχιακές σπουδές στην κοινωνική ανθρωπολογία και έλαβε το διδακτορικό του στην Εcole desHautes Etudes en Sciences Sociales (Παρίσι) το 1995. Η διατριβή του διερευνά το σώμα, τα συναισθήματα και την ανδρική ταυτότητα στους ποδοσφαιριστές και οπαδούς μιας ομάδας του Πειραιά και σε άνδρες με ομοφυλοφιλικές πρακτικές στην Αθήνα. Υπήρξε επισκέπτης καθηγητής στην Ecole des Hautes Etudes en Sciences Sociales (Παρίσι) και στα Πανεπιστήμια της Στοκχόλμης και του Γκέτεμποργκ. Είναι μέλος της Ευρωπαίκής Ενωσης Κοινωνικών Ανθρωπολόγων (EASA) και της Εταιρείας Μελέτης Ιστοριογραφίας και Θεωρίας της Ιστορίας (ΕΜΙΘΙ). Είναι διευθυντής του ΠΜΣ “Φύλο, Πολιτισμός και Κοινωνία”. Τα ερευνητικά του ενδιαφέροντα περιλαμβάνουν το φύλο, την σεξουαλικότητα, την υγεία, την συγγένεια, την σχέση μεταξύ ανθρωπολογίας και ψυχανάλυσης, τις πολιτικές της διαφοράς και τον αστικό χώρο. Στις δημοσιεύσεις του συγκαταλέγονται επιμέλειες βιβλίων και άρθρα για την φεμινιστική και queerθεωρία, τη συγκρότηση του ανδρισμού, της ομοκοινωνικότητας και της ομοφυλοφιλίας, την κοινωνική και πολιτισμική κατασκευή του Aids, τον εθνικισμό και το ποδόσφαιρο, την ανθρωπολογική και ψυχαναλυτική προσέγγιση των συναισθημάτων και της έμφυλης/σεξουαλικής υποκειμενικότητας, την αναστοχαστική ανθρωπολογία, τις «εναλλακτικές» μορφές συγγένειας, την ανάπλαση (gentrification), την έννοια της «πολυπολιτισμικότητας» και τις χωρικές πολιτικές της διαφοράς. Από το 2014 πραγματοποιεί αρχειακή και εθνογραφική έρευνα για την ανδρική ομοφυλοφιλία στη μεταπολεμική Ελλάδα.